Покой на болоте Шрека и Фионы вновь нарушен. Король Гарольд умирает. Его последняя воля ставит Шрека перед неожиданным и пугающим выбором: стать новым королем Далекого-Далекого Королевства.
Шрек ошеломлен. Мысль о троне, коронах, дворцовых интригах и ответственности за целое королевство вызывает у него панику. Он – огр болот, существо, ценящее тишину, грязь и полное отсутствие протокола. Фиона, понимая его ужас, пытается поддержать, но и она осознает тяжесть короны.
Наследственная проблема имеет решение: если Шрек найдет единственного другого законного наследника – кузена Фионы, юного Артура Пендрагона, обучающегося в волшебной школе-интернате Вустершир, – и убедит его занять трон, то Шрек сможет вернуться к своей болотной жизни.
Обрадованный возможностью избежать короны, Шрек вместе с верными, хоть и не всегда полезными спутниками – Ослом и Котом в сапогах – немедленно отправляется в путь на поиски Артура. Их миссия кажется ему единственным спасением.
Однако в королевстве не дремлют старые враги. Обиженный и отвергнутый Принц Чарминг, сын Крестной Феи, узнает о смерти короля и уязвимости трона. Пользуясь отсутствием Шрека и Фионы, он собирает армию из самых отъявленных злодеев сказочного мира, запертых до поры в казематах. Его цель проста и жестока: захватить королевство, отомстить за свои унижения и навсегда стереть память о Шреке.
Пока Шрек плывет навстречу неизвестному наследнику, Фиона, оставшаяся одна, оказывается лицом к лицу с надвигающейся угрозой. Королевство, только что потерявшее короля, не подозревает о буре, которая собирается над его стенами.
Две параллельные истории начинают раскручиваться: Шрек, бегущий от короны и невольно приближающийся к своему, возможно, единственному шансу на спасение; и Чарминг, идущий к короне с армией тьмы за спиной. А Фиона, впервые без мужа, должна найти в себе силы защитить дом, который только начал становиться ее домом. Новый вызов для огра и его семьи уже стучится в ворота – вызов, который невозможно просто перепугать своим видом как в былые времена.
